2013年6月3日，穆里尼奥时隔六年重返斯坦福桥，第二次被切尔西任命为一线队主教练，双方签约至2017年。[14]彼时的切尔西已经连续三个赛季未能登顶英超，但穆里尼奥在就职新闻发布会上说道：“如果我们没有（赢得联赛冠军），但在第一个赛季表现出了进步，表明我们正在朝着正确的方向前进，那么我们将在第二个赛季获得冠军。”
2013年6月14日，英超曼城队宣布佩莱格里尼接替遭到解雇的曼奇尼成为球队新任主教练，2004年，“工程师”执教成为比利亚雷亚尔队的主教练，并成为少数进入欧洲执教的南美教练之一，在比利亚雷亚尔队执教的5年时间里，“工程师”帮助这个只有51000人口的小城开辟了一条通向冠军的道路，成就来西甲执教的一段传奇。在智利人的带领下，“黄色潜水艇”在低预算的情况下打入欧冠四分之一决赛并在国家德比战中取得傲人成绩。“黄色潜水艇”在西甲联赛中夺得第二的佳绩，为“工程师”拿下优秀教练的美名。此后，皇家马德里相中“工程师”，于2009年6月聘请其为教练。虽然只执教了一个赛季，但佩莱格里尼仍然带领球队取得联赛96积分的优秀成绩，仅以3分惜败榜首巴塞罗那。皇马是一只拥有9次欧冠冠军头衔的球队，在“工程师”执教的赛季里是球队胜率最高的赛季。在优异的执教表现下，各大球队争相竞争曼努埃尔，而工程师选择执教马拉加，继续留任西甲。时间再一次证明“工程师”的执教能力，球队在赛季取得联赛第四的成绩，并带领球队挺近欧冠半决赛。可惜的是马拉加在两次伤停补时间断遭遇多特蒙德的进球而惜败。但不久之后，球队就在联赛积分榜上重整雄风，在“工程师”执教的最后一年取得了联赛第六的成绩。
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