在这期间，赤还吞服了奈落交给他的血色宝石，让自己断裂的左臂重新长了出来，木叶中的众人虽然对赤重新长出来的左臂十分惊奇，但是碍于赤的实力与身份，也没有人敢当面询问赤。
一个月之后，伴随着所有木叶部队全部回归木叶村，第三次忍界大战终于是宣布完结了，而就在这一天的夜里，躺在床上的赤骤然睁开了自己的双眼，身形瞬间消失在床上，流刃若火拔出，抵住了身前一名黑衣面具忍者的后心位置。
“团藏的人吗，来我这里干什么。”
流刃若火缓缓刺出，撕开了根部忍者的马甲，刺入了他的嵴背上，不过看着身前身体僵硬，好似没有任何感觉的根部忍者，赤眉头一皱，将手中的流刃若火收了起来。
“奉团藏大人的命令，邀请赤大人前往根部。”
“根部吗。”
赤一把抓起身前根部忍者胸前的衣服，将这名根部忍者从房间中丢了出去，将流刃若火插在自己的腰间，赤看着眼前的房间，面上一笑，身形瞬间消失在了房间中。
跟着房间外早已等候的两名根部忍者，赤走到了一处极为偏僻的街道，在穿过重重幻术结界之后，赤才算是来到这个隐藏了木叶几乎所有污秽与黑暗的地方，根部基地。
双眼化作三勾玉的写轮眼，赤看着隐藏在路两旁的数十名根部精锐，嘴角勾起了一抹冷笑，默不作声的跟在带队的根部身后，逐渐来到了根部的最深处。
“宇智波赤，欢迎来到根部。”
志村团藏坐在黑暗中，身后是两名精英上忍，和十数名根部的上忍，团藏看着到来的赤，面上一笑，口中传出了阴冷的笑声。
“叫我来干什么。”
赤自顾自的找了一个座椅坐下，流刃若火骤然插下，一声巨响，地面崩裂，流刃若火被赤深深插入了地面中。
“宇智波赤，老夫希望你做个明白人，宇智波一族是注定要衰落的，如果你现在选择投入根部中，老夫可以注定让你成为根部副首领，等到老夫百年之后，你便是执掌木叶之根的忍界之暗！”
志村团藏看着赤，开口说道，执掌根部这个木叶村中仅次于火影直属暗部的大势力，对于木叶村的任何人都有着十足的诱惑力，可惜，赤不在乎所谓的根部，也看不上什么忍界之暗。
“你要说的就只有这些吗，那么，我就给你一个明确的回应吧，团藏。”
赤站起身来，来到了志村团藏身前五米之处，看着瞬间出现在团藏面前的十数名根部精英，赤面上露出一抹冷漠之色：“根部的副首领？我没有兴趣做一个隐藏在黑暗中的，已经腐烂的树根。”
“即便是所谓的火影在我看来也算不上什么，不要妄图用权利来约束我，因为我对此不敢丝毫兴趣；不要试图用力量来压迫我，因为我的力量远在你，远在根部，甚至是远在木叶之上！”
“权利的游戏也好，力量的压迫也罢，亦或是你打算以所谓的宇智波一族来逼迫我妥协也好，这些手段全都没用，所谓的火之意志，我根本没有，也不会认同这样洗脑一样的可笑意志。”
流刃若火缓缓出鞘，炽热的火焰在赤的身前跃动，橙红色的火焰在一瞬间将四周的黑暗一扫而空，露出了面色凝重的根部精锐，以及被根部精锐保护在中央的，面色阴沉至极的志村团藏。
“宇智波赤！你放肆！你想要在根部动手吗！你知道这意味着什么吗！”
志村团藏双手结印，狂暴的飓风将身前逐渐蔓延而来的爆炎挡住，独目冰冷的看着被火焰包裹的赤，口中大喝道。
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